发动机水箱生锈、结垢是最常见的问题。锈迹和水垢会限制防冻液在冷却系统中的流动，降低散热作用，导致发动机过热，甚至造成发动机损坏。防冻液氧化还会形成酸性物质，腐蚀水箱的金属部件，造成水箱破损、渗漏。
解决水箱故障的办法主要在平日的例行检查，应该经常察看水箱是否有漏水或锈蚀现象，要按时清洗，更换或添加防冻液，以提高沸点，延长使用寿命。一般来说，行驶两万公里或一年时间就应更换防冻液。这样可以起到提高沸点，防止产生水垢、锈蚀及提升散热效果，使水泵产生润滑作用，避免与消除气泡引起瞬间高温所造成的发动机伤害。
用水代替防冻冷却液使用的危害，并没坊间说的那么严重，如果是短期应急使用，加水是可以的，不会对节温器有损害或者堵塞冷却水道，在赛车场就有很多赛车直接用水作冷却液。而且，如果发现防冻冷却液低于最小值，身边又没有防冻冷却液可添加，也可以加水来暂时顶替。毕竟防冻冷却液的减少主要是水分的蒸发导致的。
